问题奶粉事件发生后，石门县委、县政府高度重视，先后四次召开专题会议和紧急会议，成立了以县委常委、副县长覃志云为组长的问题奶粉查处工作领导小组，领导小组办公室设在县食品安全办。明确对食用问题奶粉的婴幼儿实行免费治疗，费用由县财政垫付。县长杨琦明、常务副县长高德知、副县长覃志云、副县长沈英琼先后多次听取情况汇报，就具体工作进行研究安排。县食品安全办、工商局、卫生局、质监局等职能部门，反应快速，措施有力。9月26日，县食品安全办召开了城区主要超市负责人会议，要求各超市搞好问题奶粉公示、退换和解释工作，并部署国庆期间食品安全工作。9月27日，县长杨琦明、副县长沈英琼、万义元督查了食品安全、药品安全、问题奶粉清退等工作，检查了楚江市场、楚江屠宰场、一完小、平安超市、金玉满堂酒楼、步行街大药房，并到县人民医院看望问题奶粉患儿，并召开各职能部门会议，提出整改要求。同日，县工商局、卫监所和楚江镇，对城区各学校奶粉使用情况进行了全面检查。特别是接到新查出了1个批次问题奶粉的通知后，县委、县政府具有高度的政治敏感性，在第一时间进行了紧急部署。于9月29日，常务副县长高德知主持召开紧急会议，贯彻落实上级有关最新精神，公安、国保、食安、商务、工商、卫生、应急办等单位负责人参加会议。会议对新查出的31批次问题奶粉的清查退市工作进行了认真研究部署，要求工商部门想方设法筹措资金，并督促代理商、经营户切实满足消费者正当退货要求，明确县财政要对确实存在资金不足或资金一时难以到位的代理商垫付资金，确保退货到位，确保不发生涉稳事件和群体事件。目前，工商人员已到全县所有超市、商店开展31批次的问题奶粉清查下架工作，县食品安全办下发紧急通知到各乡镇和相关部门，要求积极配合工商、公安等部门处理有关事宜，并实行24小时值班制度和每日报告制度。
    截止9月29日，全县共清查三鹿奶粉1302袋、351桶，其他69批次问题奶粉208.9公斤。筛查食用问题奶粉婴幼儿4659名。确诊45例，住院22人，其中已治愈出院5人。